中央音乐学院作为一所培养高级专门音乐人才的单学科高等学府，自建院以来已形成了体现教学、科研、艺术实践综合功能的，从附孝附中、大学本科到硕士研究生、博士研究生层次的完整音乐教育体系。现设作曲系、音乐学系、指挥系、音乐教育系、声乐歌剧系、钢琴系、管弦系、民乐系、交响乐学院、基础教育部、附属中小学、继续教育学院、远程音乐教育学院，以及设在教务处的古典吉他、手风琴和电子管风琴三个专业方向的直属学科等教学部门。此外，学院还设有集教学与科研为一体的音乐科技部，其中包括提琴制作研究中心、现代电子音乐中心、音乐治疗中心和嗓音研究中心等。